2023上海国际计算生物学创新大赛—药物筛选AI算法“凌越”挑战赛以NMDA受体为靶点进行药物虚拟筛选，采用真实实验进行验证，为客观评价药物筛选AI算法的实战能力提供机会。
举办方：上海市科学技术委员会（指导单位）、上海市生物医药科技发展中心（主办方）
一、大赛背景
计算生物学是一门新兴的交叉学科，结合计算机科学、数学、统计学和物理学等领域的方法，探索生物系统的结构、功能和演化，具有巨大的应用潜力和市场价值。近年来，各国高度重视计算生物学的发展，尝试利用计算生物学的方法和技术破解生物医药行业的难题。
上海作为生物医药科技创新实力最强、活力最足的区域之一，在计算生物学方面具有良好基础，但仍存在短板和不足，需要配置核心要素资源、吸引全球人才、抢占制高点，实现计算生物学高质量发展，进一步赋能生物医药科技创新和产业发展。为进一步推动计算生物学发展，落实《上海市计算生物学创新发展行动计划（2023—2025年）》，拟连续举办上海国际计算生物学创新大赛，重点聚焦算法开发、模型构建、AI药物设计等领域，吸引国内外高校、科研院所、企业和个人积极参与，通过大赛遴选人才和项目，构建人才和项目蓄水池，同时提升上海计算生物学国内外影响力。
2023上海国际计算生物学创新大赛——药物筛选AI算法“凌越”挑战赛（Click here to jump to the English Page），以NMDA（N-methyl-D-aspartate，N-甲基-D-天冬氨酸）受体靶点进行药物虚拟筛选，采用真实实验进行验证，为客观评价药物筛选AI算法的实战能力提供机会。药物筛选AI算法挑战赛长期目标是打造被行业高度认可、具有高公信力和影响力的AI药物发现平台，推动原创新靶点药物发现。
二、大赛目的
1、提升计算生物学创新水平，加快行业发展。搭建提升上海计算生物学创新水平的资源对接与生态服务平台，互通人才、技术、资金、空间、第三方服务等相关资源，加快计算生物学行业发展。
2、遴选吸引优秀人才机构，提升综合竞争力。吸引全球计算生物学相关领域人才，通过强化学科交叉、交流创新前沿、挖掘场景需求、迸发创新火花，提升上海计算生物学综合实力和竞争力。
3、打造大赛国际化品牌，提升上海计算生物学影响力。打造“上海国际计算生物学创新大赛”品牌，提升上海计算生物学国际影响力。
4、营造创新应用转化生态，形成资源对接网络。聚焦创新前沿研究和应用场景及其解决方案，建立以赛选项目、选人才机制，吸引更多创新、产业和资本资源加入，形成资源对接网络，推动算法、软件、结构等原研原创技术产品落地。
三、参赛对象
1、参赛对象：大赛面向全球社会各界开放，不限年龄、国籍，各高等院校、科研单位、企事业单位、个人等均可登录官网报名参赛。
2、报名要求：全体参赛团队成员须在本平台完成报名并组队，报名时需提供所有成员的个人基本信息，并通过实名认证即可参赛（点击此处完成认证：个人认证）；
3、组队要求：每位参赛者仅可组建或者加入一支参赛团队，不允许更换团队；每支参赛团队限定1-5人。由队长在华为云赛道大赛平台<我的团队>创建队伍（团队名称由队长自行拟定，可以自由选择是否公示单位名称），其他全部队员搜索团队名称加入。参赛选手需在报名截止日期前完成组队。
说明：
1、参与赛题谋划和大赛组织的相关人员不得参赛。
2、参赛账号仅限参赛者本人使用，不得将其以任何形式向第三方转让、出租、出借、出售、披露、泄露等。参赛者有义务保证账号信息的真实性和有效性，因信息无效或错误造成的后果由参赛者自行承担。参赛者对参赛账号的使用自行承担责任，遭遇安全问题（如账号遗失、被盗、被未授权使用等）时应立即通知组委会。
四、赛题与数据
1、赛题简述：
蛋白-配体相互作用识别是药物设计的核心问题。通俗来说，一个蛋白就像一把“锁”，而药物就像一把“钥匙”，基于形状及性质互补配对的原理结合到蛋白上。互补性高、与锁孔更适配的药物分子具有较强的活性与治疗效果。虚拟筛选希望基于锁孔的结构（蛋白结构），设计算法从海量的候选钥匙（分子）中精准挑选出有可能结合的小部分进行实验验证，提高药物发现效率与成功率。
本次大赛关注的蛋白靶标是NMDA（N-methyl-D-aspartate，N-甲基-D-天冬氨酸）受体。NMDA受体与多种疾病相关，如脑卒中、抑郁症、癫痫、阿尔兹海默症、疼痛等，是神经系统疾病最热门的药物开发靶点之一，靶向NMDA受体的药物开发具有重要的临床意义和市场价值。GluN1/GIuN3A是NMDA受体亚型之一，尚未作为靶点广泛开发。特异性小分子调节剂以及晶体结构信息的匮乏，极大地限制了GluN1/GluN3A的进一步研究。
本次大赛希望选手基于NMDA受体家族已知的蛋白序列、结构及活性分子信息，通过AI计算方法发现潜在的特异性作用于GluN1/GluN3A受体的高活性分子。同时，大赛将结合湿实验验证，为进一步开展药物研发奠定重要基础，并使真正有价值且表现稳健的AI算法崭露头角，推进AI药物研发。（具体赛题说明见“赛题详情”页面）
2、小分子化合物库：
①本赛题指定化合物库，共包含约1800万个化合物及其详细信息，筛选得到的化合物由主办方购买；
②为鼓励原创新药的发现，本次大赛接受参赛团队提交从头生成的全新化合物样品实体。
五、赛程安排
本次比赛包括报名、初赛和决赛三个阶段：
（一）报名（2023年12月14日 18:00-2024年2月29日 18:00）
参赛者以个人或组队形式报名参加（均需要创建参赛团队），并在规定时间内完成作品提交；主办方将于2024年3月公布入选团队及分子。参赛团队需提交的作品包括：
（二）初赛（2024年3月1日-2024年8月31日）
在初赛阶段，主办方对参赛分子进行湿实验验证和评价，并于2024年8月31日公布晋级决赛的团队名单。初赛包括以下三个环节：
（三）决赛（2024年9月）
晋级决赛的5支参赛团队将受邀进行现场答辩，由决赛评委会进行打分，并现场公布各团队的答辩成绩。
主办方将对参赛团队的湿实验成绩（70%）及答辩成绩（30%）进行加权积分，决出一、二、三等奖。
注意：决赛答辩相关要求及评分说明，将于决赛开始前在大赛平台公布，请参赛者及时关注大赛官方信息。
六、大赛交流
1、大赛官方交流论坛：比赛过程中参赛团队可以到ModelArts社区（ModelArts开发讨论板块）发帖，标题命名为：【“上海计算生物学大赛”+您的问题】，正文详细描述您遇到的问题（可附截图），大赛组委会工作人员将会在工作时间（9:00-17:00）通过社区回复，点击此处查看您提出的所有问题。
说明：为保证大赛公平公正，大赛官方仅针对ModelArts使用问题、赛题、数据、评分、大赛安排等问题进行答疑，参赛团队的代码调试问题不做解答。如没有得到及时回复，可以将社区帖链接发至交流群，反馈给工作人员。
2、参赛团队答疑群：请参赛团队务必扫描如下小助手二维码，回复“上海计算生物学大赛”进入交流群，以便开展大赛交流答疑。大赛组委会将在群内第一时间发布大赛重要节点、直播信息、获奖名单等重要大赛信息。
七、组织机构
指导单位：上海市科学技术委员会
主办单位：上海市生物医药科技发展中心
联合主办单位：中国科学院上海药物研究所原创新药研究全国重点实验室、中国银行上海市分行、华为云计算技术有限公司、临港实验室、上海人工智能研究院、东方美谷企业集团股份有限公司、上海大宁资产经营（集团）有限公司
承办单位：上海生物医药公共技术服务有限公司、上海市生物医药产业技术功能型平台
协办单位：上海皓元生物医药科技有限公司（MCE中国）
八、其他说明
若出现以下情况，将视为违规，大赛组委会有权取消参赛团队的参赛资格：
1、参赛报名信息虚假，或不符合大赛报名及组队要求的参赛者/参赛团队；
2、参赛作品涉嫌抄袭，侵犯他人知识产权等行为；
3、参赛期间或参赛作品被发现或被举报认定存在的其他违法、违规行为；
4、大赛数据：组委会仅授权参赛人员使用本次大赛提供的数据进行模型训练工作，参赛人员不得将本次比赛的提供的模型训练数据用于任何商业用途；
5、比赛知识产权相关约定参考页面底部附件1《知识产权约定》。
本届大赛规程最终解释权归大赛组委会所有。
活动官方地址： https://competition.huaweicloud.com/information/1000042002/introduction
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